Priča predstav Genijalni genije prati Leonarda da Vincija u pokušaju ostvarenja nekih od svojih najgenijalnijih izuma poput automobila, zrakoplova ili podmornice, a koji su uspješno realizirani tek stoljećima kasnije.
Vizionar ispred svog vremena bio je neshvaćen idejama koje su se tadašnjim ljudima činile kao potpuna ludost, a pomalo i samom Leonardu kojega su vlastiti strahovi i sumnje priječili da vjeruje u sebe.
Njegovi strahovi, iako nestvarni, utjelovljeni su Ljudima (lutkama) koji nakon svakog izuma viču: “Lud, lud! Leonardo je luđak!”
Iako su Ljudi samo u njegovoj glavi, to ne znači da za njega nisu stvarna prijetnja. Za Leonarda su on i njegov vjerni pomoćnik Francesco sami protiv cijelog svijeta. No na kraju se sa svojim strahovima ipak hvata u koštac...